มหาวิทยาลัยหอการค้าไทยก่อตั้งขึ้นครั้งแรกในปี พ.ศ. 2483 โดยใช้ชื่อว่า "วิทยาลัยการค้า" มีที่ทำการ ณ สำนักงานของหอการค้าไทยในปัจจุบัน โดยงานการเงินยังมิได้แยกออกมาจากหอการค้าไทย
ในปี พ.ศ. 2517 วิทยาลัยการค้าได้ย้ายที่ทำการมาอยู่ ณ ที่แห่งใหม่บริเวณหลังวิทยาลัยป้องกันราอาณาจักร (วปอ.) เลขที่ 126/1 ถนนวิภาวดีรังสิต เขตดินแดง กรุงเทพฯ 10400 โดยมีศาสตราจารย์ปัจจัย บุนนาค ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการวิทยาลัยการค้าในสมัยนั้น และได้จัดตั้งกองคลังขึ้นเพื่อทำหน้าที่ดูแลงานการเงินของวิทยาลัยการค้า โดยมีนางนงลักษณ์ ธรรมกรบัญญัติ ดำรงตำแหน่งหัวหน้ากองคลัง ซึ่งกำกับดูแลงาน 2 แผนก คือ แผนกบัญชีและแผนกการเงิน
ต่อมาในปี พ.ศ. 2527 วิทยาลัยการค้า ได้รับอนุมัติจากทบวงมหาวิทยาลัยให้ยกฐานะเป็นมหาวิทยาลัยโดยใช้ชื่อว่า "มหาวิทยาลัยหอการค้าไทย" จึงได้ปรับโครงสร้างหน่วยงานโดย ยกเลิกกองคลังและยกฐานะแผนกทั้ง 2 แผนกเป็นกองใช้ชื่อว่า กองบัญชีและงบประมาณ และกองการเงิน โดยมีนางนงลักษณ์ ธรรมกรบัญญัติ เป็นหัวหน้ากองการเงินมาโดยตลอด
ต่อมาในปี พ.ศ. 2543 นางนงลักษณ์ ธรรมกรบัญญัติ ซึ่งดำรงตำแหน่งหัวหน้ากองการเงินได้เกษียณอายุในเดือน สิงหาคม 2543 มหาวิทยาลัยจึงได้แต่งตั้งอาจารย์วนิดา สมส่งกุล ดำรงตำแหน่งรักษาการหัวหน้ากองการเงิน จนถึงเดือนธันวาคม 2543
เดือนมกราคม 2544 มหาวิทยาลัยได้แต่งตั้งให้นายวิชิต งามไสวไชยกุล ดำรงตำแหน่งหัวหน้ากองการเงิน จนถึงธันวาคม 2554
เดือนมกราคม 2555 มหาวิทยาลัยได้แต่งตั้งให้อาจารย์นิลเพชร บุญรอด ดำรงตำแหน่งหัวหน้ากองการเงิน จนถึง
กุมภาพันธ์ 2556
เดือนมีนาคม 2556 มหาวิทยาลัยได้แต่งตั้งให้นางชนัญญา ธรรมนิพิท ดำรงตำแหน่งหัวหน้ากองการเงิน จนถึงปัจจุบัน ซึ่งมีที่ทำการตั้งอยู่ที่อาคาร 10 ชั้น 1
